پژوهشکده گیاهان دارویی جهاد دانشگاهی به عنوان مرکز پژوهش و تحقیقات گیاهان دارویی کشور و منطقه در سال ۱۳۷۷ تاسیس و در سال ۱۳۸۰ به عنوان مرکز تحقیقات گیاهان دارویی جهاد دانشگاهی کشور مورد تصویب شورای گسترش دانشگاه‌های علوم پزشکی وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی کشور قرار گرفت. در این پژوهشکده بیش از ۵۰ عضو هیات علمی و محقق فعالیت می‌کنند. زمینه فعالیت پژوهشکده گیاهان دارویی شامل، تحقیقات کاربردی گیاهان دارویی و داروهای طبیعی، خدمات تخصصی در زمینه‌های آنالیز، فرمولاسیون، تولید نهال، بذر و فرآورده‌های دارویی گیاهی و گیاهان دارویی می‌باشد.